威尼斯432888can-首頁(欢迎您!)

内网

检测到您当前使用浏览器版本过于老旧,会导致无法正常浏览网站;请您使用电脑里的其他浏览器如:360、QQ、搜狗浏览器的极速模式浏览,或者使用谷歌、火狐等浏览器。

下载Firefox
苏晓东

邮  箱: xdsu@pku.edu.cn

职  称:教授

传  真:86-10-62762292

办公室电话:62759743

实验室电话:62759624

实验室地址:北京市海淀区颐和园路5号,综合科研2号楼,100871

  • 个人简介
  • 科研领域
  • 代表性论文

个人介绍:

     苏晓东:博导,国家杰出青年,教育部长江学者,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)常务副主任,北京大学威尼斯432888can长江特聘教授。
     主要研究领域为结构生物学、生物化学及分子生物学、单分子生物物理、新一代基因组测序技术、基于结构的药物及抗体工程及合理化设计等。 自1994年得到博士学位以来,已经发表各类学术论文近二百篇,译作及著作5部(包括书中章节),翻译了结构生物学畅销教科书《结构生物学—从原子到生命》。 在国际权威学术期刊如Cell; Nature; Science; Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol.; Nature methods; Nat. Strucut. & Mole. Biol. (NSMB); Genome Research; PNAS; Cell Research; EMBO J.; EMBO Rep.; Cell Rep.; Nucleic Acid Research(NAR); J. Biol. Chem.; J. Mol. Biol.; J. Immuno.; 等国际著名学术期刊发表论文。 承担Cell等重要国际科学期刊审稿人, 多次参加国家自然科学基金委各种项目的评审工作。历任国际晶体学联合会(IUCr)大分子晶体学专业委员会主席;中国晶体学会理事长、前秘书长、前大分子专业委员会主任;中国生物物理学会单分子生物学分会主席等职务;以及担任北京大学“蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室”副主任,BIOPIC常务副主任等职。
     苏晓东教授近十五年来,在北京大学建成大规模、高通量、半自动化蛋白克隆、表达、纯化、结晶以及晶体结构解析技术平台,实现了高通量进行结构基因组学(蛋白晶体学)研究的目标,在国际相关领域有一定的影响;同时研发具有独立知识产权的以蛋白质晶体学为主要手段的结构生物学自动化系统及相关方法、设备,进一步提高自动化程度,降低成本。发展基于三维结构的大分子药物(抗体及疫苗等)、小分子药物及大小分子联用药物的设计与研发; 利用现代化高通量深度测序技术(NGS)研究肿瘤基因组学以及相关的微生物的宏基因组学,力图发展新的技术方法,发现新的疾病相关基因及基因突变。

教育经历:

1988年-1994年 就读于瑞典Karolinska医学院细胞与分子生物学系,并获得分子生物学博士学位
1985年 - 1987年 北京大学医学部生物物理专业研究生
1980年-1985年 本科毕业于北京大学物理系(现物理学院)

荣誉奖励:

Bayer Investigator Award (拜耳学者奖),2016
国家基金委(NSFC)“国家杰出青年科学基金”,2003
教育部“长江学者”奖励,2002

工作经历:

2003年 - 至今 北京大学威尼斯432888can长江特聘教授,北大“蛋白质与植物基因研究国家重点实验室”副主任
1998年-2002年 历任瑞典隆德(Lund)大学化学中心助教授和副教授
1995年-1998年 在美国加州理工学院生物学部Howard Hughes医学研究所(HHMI)作博士后研究,师从免疫结构生物学著名教授Pamela Bjorkman

学术任职:

现任国内外主要学术职位:
亚洲晶体学会(AsCA)主席
中国晶体学会(CCrS)理事长
中国生物物理学会,“单分子生物学”分会主席
国际专业期刊“Crystallography Reviews”编委
国际著名期刊“Protein and Cell”编委

曾经任职:
国际晶体学联合会(IUCr)大分子晶体学专业委员会(CBM)主席(2011-2014)
中国晶体学会秘书长、副理事长
中国晶体学会生物大分子专业委员会主席
“生物物理与生物化学进展”编委
      本实验室主要兴趣在于:
  利用X-射线晶体学手段及其它物理、化学、遗传学技术研究生物学和临床医学的基本问题;特别是研究物质代谢系统,蛋白质体内合成系统,以及与细胞凋亡和肿瘤的信号传导机制相关的蛋白质结构。
  基于结构的蛋白质工程及药物(蛋白和小分子药物)设计方法。
  利用常规及同步辐射X光源研究结构生物学方法,特别是单波长异常散射方法和低分辨率从头定相位方法;
  利用和开发不同宿主系统来表达,纯化那些重要且难于制备的蛋白分子,特别是用于结构和功能研究的糖蛋白,膜蛋白等。
  利用生化及物理学手段研究大分子相互作用及识别机理,特别是功能大分子复合物,细胞黏附,以及它们在神经系统发育,癌症发生及转移中的作用功能
    
1. Shuo Du, Yunlong Cao, Qinyu Zhu, Pin Yu, …… X Sunney Xie*, Xiao-dong Su*, Junyu Xiao*, Chuan Qin*. Structurally resolved SARS-CoV-2 antibody shows high efficacy in severely infected hamsters and provides a potent cocktail pairing strategy. Cell (2020) 183:1-11
2. Xu YP, Xu H, Wang B, Su XD*. Crystal structures of N-terminal WRKY transcription factors and DNA complexes. Protein & Cell (2020) 11, 208–213
3. Zhen Zhao, Zhixing Ma, Bo Wang,Yukun Guan, Xiao-Dong Su*,Zhengfan Jiang*.Mn2+ Directly Activates cGAS and Structural Analysis Suggests Mn2+ Induces a Noncanonical Catalytic Synthesis of 2′3′-cGAMP. Cell Reports 32 (7), 108053, August 18, 2020.
4. Kai Yu, Yuqiong Hu, Fan Wu, Qiufang Guo, Zenghui Qian, Waner Hu, Jing Chen, Kuanyu Wang, Xiaoying Fan, Xinglong Wu, John EJ Rasko, Xiaolong Fan, Antonio Iavarone*, Tao Jiang*, Fuchou Tang*, Xiao-Dong Su*. Surveying brain tumor heterogeneity by single-cell RNA sequencing of multi-sector biopsies. National Science Review (NSR) (2020) 7:1306-18.
5. Wang C, Guan Y, Lv M, Zhang R, Guo Z, Wei X, Du X, Yang J, Li T, Wan Y, Su X, Huang X, Jiang Z. “Manganese Increases the Sensitivity of the cGAS-STING Pathway for Double-Stranded DNA and Is Required for the Host Defense against DNA Viruses.” Immunity. (2018) pii: S1074-7613(18)30093-1. doi: 10.1016/j.immuni.2018.03.017.
6. Ming-jing Deng, Chao E, Jianli Tao, Zhao-yang Ye, Zhengfan Jiang, Jin Yu, Xiao-dong Su “Novel mechanism for cyclic di-nucleotide degradation revealed by structural studies of Vibrio phosphodiesterase V-cGAP3” (2018) JMB 430(24):5080-5093. doi: 10.1016/j.jmb.2018.10.010.
7. Lian TF, Xu YP, Li L, Su XD* “Crystal Structure of tetrameric Arabidopsis MYC2 reveals the mechanism of enhanced interaction with DNA” Cell Reports (2017) 19(7):1334-1342.
8. Jianli Tao, Xiao-Wei Zhang, Jianshi Jin, Xiao-Xia Du, Tengfei Lian, Jing Yang, Xiang Zhou, Zhengfan Jiang, and Xiao-Dong Su. Nonspecific DNA Binding of cGAS N Terminus Promotes cGAS Activation J. Immuno. (2017) 198(9):3627-3636. doi: 10.4049/jimmunol.1601909.
9. Jin JS, Lian TF, Gu C, Yu K, Gao YQ*, Su XD* “The effects of cytosine methylation on general transcription factors” (2016) Sci Rep.; 6:29119. doi:10.1038/srep29119.
10. Bajar BT, Lam AJ, Badiee RK, Oh YH, Chu J, Zhou XX, Kim N, Kim BB, Chung M, Yablonovitch AL, Cruz BF, Kulalert K, Tao JJ, Meyer T, Su XD, Lin MZ. “Fluorescent indicators for simultaneous reporting of all four cell cycle phases.” Nat Methods. (2016); 13(12):993-996. doi: 10.1038/nmeth.4045
11. Xiao-Jun Wang, Qin Cao, Yan Zhang and Xiao-Dong Su*, “Activation and Regulation of Caspase-6 and Its Role in Neurodegenerative Diseases”, Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., 2015; 55:553-72. doi: 10.1146/annurev-pharmtox-010814-124414.
12. Gao J, Tao J, Liang W, Zhao M, Du X, Cui S, Duan H, Kan B, Su X*, Jiang Z.* Identification and characterization of phosphodiesterases that specifically degrade 3'3'-cyclic GMP-AMP. Cell Res. 2015 May;25(5):539-50. doi: 10.1038/cr.2015.40.
13. Bao ZS, Chen HM, Yang MY, Zhang CB, Yu K, Ye WL, Hu BQ, Yan W, Zhang W, Akers J, Ramakrishnan V, Li J, Carter B, Liu YW, Hu HM, Wang Z, Li MY, Yao K, Qiu XG, Kang CS, You YP, Fan XL, Li RQ, Su XD, Chen CC, Jiang T. “RNA-Seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ-MET fusion transcript in secondary glioblastomas” Genome Research , Genome Research , 2014 , 24(11):1765-73
14. Qin Cao, Xiao-Jun Wang, Lan-fen Li and Xiao-Dong Su*, “The regulatory mechanism of caspase-6 pro-domain revealed by crystal structure and biochemical assays”, Acta Crystallogr Sect D Struct Biol. 2014 , 70(Pt 1):58-67.
15. Zixi Wang, Lanfen Li, Xiao-Dong Su*, Structure of human CLOCK-BMAL1 bHLH domains and DNA complex provides insights into protein-protein/DNA recognition and transcription control , Cell Res. , 2013 , 23(2):213-24.
16. Kim S, Broströmer E, Xing D, Jin J, Chong S, Ge H, Wang S, Gu C, Yang L, Gao YQ, Su XD*, Sun Y*, Xie XS*. , Probing allostery through DNA.” Science. , 2013 , 339(6121):816-9.
17. Ni X, Zhuo M, Su Z, Duan J, Gao Y, Wang Z, Zong C, Bai H, Chapman A, Zhao J, Xu L, An T, Ma Q, Wang Y, Wu M, Sun Y, Wang S, Li Z, Yang X, Yong J, Su XD, Lu Y, Bai F*, Xie XS*, and Wang J*, “Reproducible Copy Number Variation Patterns among Single Circulating Tumor Cells of Lung Cance Patients”, PNAS 110(2013), 2013, pp21083-21088.
18. Huang YH, Liu XY, Du XX, Jiang ZF & Su XD* “The Structural Basis for the Sensing and Binding of Cyclic di-GMP by STING” (2012) Nature Structural & Molecular Biology, 219(7):728-30. doi: 10.1038/nsmb.2333.
19. Xiao-Jun Wang, Xiang Liu, Kai-Tuo Wang, Wei Mi, Yan Zhang, Lan-Fen Li, Andrea C. LeBlanc*, Xiao-Dong Su* “Crystal structures of human caspase-6 reveal a novel intramolecular cleavage self-activation mechanism” (2010) EMBO Rep. 11(11):841-7. Epub 2010 Oct 1.
20. Ming-Rui Duan, Jie Nan, Yu-He Liang, Peng Mao, Lu Lu, Luhua Lai, Yi Li, and Xiao-Dong Su , DNA Binding Mechanism Revealed by High Resolution Crystal Structure of Arabidopsis thaliana WRKY1 Protein , Nucleic acid research , 2007 , 35(4):1145-54
21. Brostromer E, Nan J. and Su XD , An automated image-collection system for crystallization experiments using SBS standard microplates , Acta Crystallogr D Biol Crystallogr., 2007, 63:119-25
22. Su XD, Liang Y, Li L, Nan J, Brostromer E, Liu P, Dong Y, Xian D , A large-scale, high-efficiency and low-cost platform for structural genomics studies , Acta Crystallogr D Biol Crystallogr , 2006 , 62(8):843-51
23. Yu Y, Liang YH, Brostromer E, Quan JM, Panjikar S, Dong YH, Su XD , A catalytic mechanism revealed by the crystal structures of the imidazolonepropionase from Bacillus subtilis , J. Biol. Chem. , 2006 , 281(48):36929-36
24. Hui Ren, Liya Wang, Matthew Bennett, Yuhe Liang, Xiaofeng Zheng, Fei Lu, Lanfen Li, Jie Nan, Ming Luo, Staffan Eriksson, Chuanmao Zhang, and Xiao-Dong Su , The Crystal Structure of human Adenylate Kinase 6: An Adenylate Kinase Localized to the Cell Nucleus , Proc. Natl. Acad. Sci. USA (PNAS) , 2005 , 102:303-308
25. Marcia Alvarez-Fernandez, Yuhe Liang, Magnus Abrahamson and Xiao-Dong Su, Crystal structure of human cystatin D, a cysteine peptidase inhibitor with restricted inhibition profile, J. Biol. Chem. , 2005 , 280:18221-18228
26. Selmer, M.; and Su, X.-D., Crystal structure of an mRNA binding fragment of Moorella thermoacetica SelB , EMBO J. , 2002 , 21(15):4145-53
27. Bennett, M.; Guan, Z.; Laurberg M. and Su, X-D, Bacillus subtilis arsenate reductase is structurally and functionally similar to low molecular-weight protein tyrosine phosphatases , Proc. Natl. Acad. Sci. USA (PNAS) , 2001 , 98:13577-13582

检测到您当前使用浏览器版本过于老旧,会导致无法正常浏览网站;请您使用电脑里的其他浏览器如:360、QQ、搜狗浏览器的极速模式浏览,或者使用谷歌、火狐等浏览器。

下载Firefox